簡要描述:mRNA疫苗的研發(fā)與生產(chǎn)需要一系列酶的參與:mRNAT7聚合酶、無機焦磷酸酶、RnaseInhibitor、加帽酶以及2′O-甲基轉(zhuǎn)移酶、Poly(A)聚合酶和DNAase等主要7種酶。起發(fā)生物提供全線mRNA體外轉(zhuǎn)錄原料
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應用領(lǐng)域 | 生物產(chǎn)業(yè) |
mRNA疫苗相關(guān)產(chǎn)品-起發(fā)生物
起發(fā)生物提供mRNA 核苷和酶原料 mRNA合成技術(shù)服務助力核酸藥物,向世界產(chǎn)品看齊。
關(guān)鍵詞 mRNA 核苷 ,mRNA核心原料,高產(chǎn)量T7酶 ,高產(chǎn)率mRNA, mRNA合成,mRNA疫苗,mRNA藥物,mRNA解決方案,mRNA定制,mRNA CRO,N1-UTP(甲基假尿苷),P-UTP,Pseudo-UTP(假尿苷)
一 mRN藥物簡介
基于mRNA的治療,簡單來講就是利用化學修飾后的mRNA分子進入細胞質(zhì)中,利用細胞質(zhì)內(nèi)的自有核苷酸進行轉(zhuǎn)錄表達,生成機體所需要的蛋白質(zhì)。上世紀90年代,mRNA藥效被初步證實,之后大量的精力投入到了mRNA藥物的研發(fā)中。
mRNA藥物開發(fā)的主要技術(shù)門檻在于穩(wěn)定性和遞送,若相關(guān)難點能夠得以解決,mRNA藥物就可作為蛋白質(zhì)補充或替代療法治療相關(guān)疾病。尤其是隨著癌癥基因測序和抗原表位發(fā)現(xiàn)等技術(shù)的發(fā)展,mRNA藥物也可用于針對腫瘤患者的個性化治療,并具有巨大的應用潛力。目前在mRNA腫瘤藥物開發(fā)領(lǐng)域進展較快的企業(yè)主要是Moderna、BioNTech和CureVac。
二、mRNA合成過程所需原料
(一)國內(nèi)外mRNA X冠疫苗的合成工藝
BioNTech/輝瑞、Moderna和艾博生物mRNA疫苗的合成工藝如下:
1)BNT162b2–BioNTech/輝瑞
三核苷酸cap1類似物((m27,3′-O)Gppp(m2'-O)ApG)(TriLink)和N1-甲基假尿苷-5′-三磷酸(m1ψTP)(ThermoFisherScientific)取代尿苷-5′-三磷酸(UTP)的存在下,通過T7RNA聚合酶對DNA進行純化和體外轉(zhuǎn)錄。
總結(jié):轉(zhuǎn)錄采用一步法,帽子類似物作引物;甲基假尿苷取代尿苷。
2)mRNA-1273–Moderna
利用優(yōu)化的T7RNA聚合酶介導的轉(zhuǎn)錄反應在體外合成了編碼序列優(yōu)化的mRNA,尿苷被N1-甲基假尿苷*取代。轉(zhuǎn)錄后,使用牛痘苗封蓋酶(新英格蘭生物實驗室)和痘苗2′O-甲基轉(zhuǎn)移酶(新英格蘭生物實驗室)將Cap1結(jié)構(gòu)添加到5’端。通過oligodT親和純化純化mRNA,通過切向流過濾將緩沖液交換到pH為5.0的醋酸鈉中,無菌過濾,并在-20°C下冷凍,直到進一步使用。
總結(jié):轉(zhuǎn)錄采用兩步法,需要加帽酶的參與,甲基假尿苷取代尿苷。
3)ARCoV-艾博生物
該mRNA在體外使用T7RNA聚合酶介導的轉(zhuǎn)錄從質(zhì)粒ABOP-028(GENEWIZ)的線性化DNA模板中產(chǎn)生,該質(zhì)粒編碼SARS-CoV-2的密碼子優(yōu)化RBD區(qū)域,并包含5’和3‘的未翻譯區(qū)域(UTR)和一條poly-a尾巴,以未修飾的NTP作為原料和T7聚合酶體外進行mRNA的合成,使用了牛痘加帽系統(tǒng)(VacciniaCappingSystem)(Novoprotein)進行加帽。
總結(jié):轉(zhuǎn)錄采用兩步法,需要加帽酶的參與。
(二)mRNA制備過程原料
mRNA制備過程需要用到的主要原料包括質(zhì)粒DNA模板、一系列酶(主要為7種酶)以及底物核苷酸等;
1、模板DNA所需原料:質(zhì)粒
DNA模板生產(chǎn),主要是質(zhì)粒的生產(chǎn)。編碼抗原的DNA模板,通過質(zhì)粒轉(zhuǎn)染到大腸桿菌大規(guī)模體內(nèi)表達,最后提取和純化攜帶目的序列的質(zhì)粒,即得到DNA模板。目前質(zhì)粒的生產(chǎn)提取和純化工藝很成熟,可以自建生產(chǎn)線或者外包出去,例如輝瑞自建質(zhì)粒生產(chǎn)工廠,大部分mRNA企業(yè)外包,Moderna和國內(nèi)企業(yè)目前是外包。
制備mRNA質(zhì)粒的要求:質(zhì)粒用于制備mRNA,這類DNA本身不屬于API,DNA需要按照GMP規(guī)范進行,GMP質(zhì)粒要求生產(chǎn)設備必須是專用的、符合GMP規(guī)范且配備潔凈間
2、mRNA體外轉(zhuǎn)錄所需原料:一系列酶+核苷酸底物
mRNA疫苗的研發(fā)與生產(chǎn)需要一系列酶的參與:mRNAT7聚合酶、無機焦磷酸酶、RnaseInhibitor、加帽酶以及2′O-甲基轉(zhuǎn)移酶、Poly(A)聚合酶和DNAase等主要7種酶。
起發(fā)生物提供全線mRNA體外轉(zhuǎn)錄原料 如下表:
產(chǎn)品編號 | 產(chǎn)品名稱 | 品牌 |
78MRNA-1001 | ATP - Solution (100 mM) | BIOHUB |
78MRNA-1002 | CTP - Solution (100 mM) | BIOHUB |
78MRNA-1003 | GTP - Solution (100 mM) | BIOHUB |
78MRNA-1004 | UTP - Solution (100 mM) | BIOHUB |
78MRNA-1005 | NTP Bundle (100 mM) | BIOHUB |
78MRNA-1101 | N1-Methyl-Pseudo-UTP (100 mM) | BIOHUB |
78MRNA-1102 | Pseudo-UTP (100 mM) | BIOHUB |
78MRNA-1103 | RNase Inhibitor - recombinant (40000 U/mL) | BIOHUB |
78DA10001 | Recombinant RNase Inhibitor(Porcine)(40000 U/mL) | BIOHUB |
78MRNA-1104 | T7 RNA Polymerase (1 KU/μL) | BIOHUB |
78MRNA-1105 | Vaccinia Capping Enzyme (10 KU/mL) | BIOHUB |
78MRNA-1106 | mRNA Cap 2′-O-Methyltransferase (50 U/μL) | BIOHUB |
78MRNA-1107 | EGFP mRNA (Pseudouridine, Ψ) | BIOHUB |
78MRNA-1109 | Pyrophosphatase,Inorganic | BIOHUB |
78MRNA-1110 | Deoxyribonuclease I (DNase I) | BIOHUB |
78MRNA-1111 | S-adenosylmethionine (SAM)(32mM) | BIOHUB |
78MRNA-1112 | 5-Methyl-CTP (100mM) | BIOHUB |
78MRNA-1113 | 5-Methoxy-UTP (100mM) | BIOHUB |
78MRNA-1114 | BsaI (20 U/μL) | BIOHUB |
78MRNA-1115 | 2'OMe-ATP(100mM) | BIOHUB |
2.1轉(zhuǎn)錄過程所需要的酶
RNA聚合酶體系:RNA聚合酶是體外轉(zhuǎn)錄mRNA的關(guān)鍵酶。
T3、T7和SP6RNA聚合酶分別對T3、T7和SP6噬菌體啟動子具有高度的特異性。將目的基因序列克隆到T7和SP6啟動子下游的多克隆位點中,以克隆的DNA為模板體外合成相應的RNA。
T7RNAPolymerase(T7RNA聚合酶)【78MRNA-1104】高度特異識別T7啟動子序列,以含有T7啟動子序列的單鏈或雙鏈DNA為模板,以核甘酸(NTP)為底物,合成與啟動子下游的單鏈DNA互補的RNA。
無機焦磷酸酶【78MRNA-1109】:加入無機焦磷酸酶,增加RNA產(chǎn)量。無機焦磷酸酶(PPase)可催化無機焦磷酸鹽水解生成正磷酸鹽,可以為蛋白、RNA和DNA的生物合成反應提供動力,促進產(chǎn)物的生成。在工業(yè)化生產(chǎn)mRNA疫苗的時候會產(chǎn)生大量的無機焦磷酸鹽,為了保證mRNA疫苗高效生產(chǎn),可以添加無機焦磷酸酶,可解除生成的無機焦磷酸鹽對反應體系的抑制。
RNase抑制劑【78MRNA-1103/78DA10001】:防止RNA的降解。少量RNase在RNA制備過程中引入,會導致RNA的降解,污染可能通過實驗過程中使用的槍頭、試管(離心管)和其他試劑引入。通常使用RNase抑制劑作為減少和控制此類污染物的預防措施。
RNase抑制劑能與RNaseA形成1:1復合體,抑制RNase活性,在mRNA疫苗研發(fā)和生產(chǎn)過程需要保持mRNA的穩(wěn)定性以保證疫苗高質(zhì)量的生產(chǎn)。
2、轉(zhuǎn)錄所需材料-核苷酸和修飾核苷酸
mRNA疫苗研發(fā)中常進行假尿嘧啶化修飾,尿嘧啶修飾是豐富的RNA修飾,一般由尿苷的異構(gòu)化產(chǎn)生,mRNA的假尿嘧啶化修飾主要有三個功能:改變密碼子、增強轉(zhuǎn)錄本穩(wěn)定性和應激反應應答。
3、加帽和加尾:共轉(zhuǎn)錄加帽/模板加尾,轉(zhuǎn)錄后加帽/加尾
真核生物體內(nèi)會對轉(zhuǎn)錄形成的mRNA進行加帽,即在mRNA的5’端添加一個甲基化的鳥苷酸帽子(m7GPPPN結(jié)構(gòu)),從而保護mRNA免遭核酸外切酶的攻擊以增加mRNA的穩(wěn)定性,并且協(xié)助mRNA與核糖體的結(jié)合以促進翻譯起始。生物體內(nèi)的帽子結(jié)構(gòu)有cap0,cap1,cap2三種形式,牛痘病毒加帽酶能夠在mRNA的5’端添加cap0帽子,再使用甲基轉(zhuǎn)移酶處理即可得到cap1帽子。
此外,5'帽子還參加mRNA前體的剪接,參與mRNA3'末端多聚腺苷酸化,保證mRNA在細胞質(zhì)中的穩(wěn)定運輸。
加帽需要的酶:牛痘病毒加帽酶
可以將7-甲基鳥苷帽結(jié)構(gòu)(m7Gppp,Cap0)加到RNA的5末端,大幅提高mRNA的穩(wěn)定性和啟動mRNA的翻譯。牛痘病毒加帽酶能夠在一小時之內(nèi)對mRNA進行加帽,效率接近100%。
在mRNA疫苗研發(fā)生產(chǎn)過程中,mRNA加帽效率和加帽mRNA穩(wěn)定表達的效率對疫苗的工業(yè)化生產(chǎn)有重大的影響。牛痘病毒加帽酶體系加帽的mRNA在細胞內(nèi)的表達效率大于帽子類似物mRNA的表達效率。
加尾酶:Poly(A)聚合酶
Poly(A)聚合酶可以催化ATP以AMP的形式依次摻入到RNA的3末端,即在RNA的3末端加多聚A尾。Poly(A)尾巴能夠增強mRNA的穩(wěn)定性、提高翻譯起始效率、引導mRNA出核。
主要用到的酶:
1)牛痘病毒加帽酶【78MRNA-1105】:
2)痘苗2′O-甲基轉(zhuǎn)移酶【78MRNA-1106】
3)Poly(A)聚合酶
加帽酶非常昂貴,如何替代加帽酶?
一步法合成mRNA疫苗產(chǎn)品的加帽可以在mRNA的體外轉(zhuǎn)錄過程中通過摻入“帽子序列"實現(xiàn),這種加帽技術(shù)會將加帽序列反向加在mRNA上,在反應體系中加入5’帽類似物,可以省一個加帽酶,以及減少純化步驟,一定程度上降低成本(尤其是節(jié)省了昂貴的加帽酶成本),但相對應地,產(chǎn)量較之兩步法(加帽酶參與)減少,因為加帽酶的加帽效率更高。
4、消除DNA模板:需要DNA酶【78MRNA-1110】
合成后的產(chǎn)物可能會有DNA殘留,在疫苗開發(fā)階段,殘留的去除是關(guān)鍵的步驟,以減少下游純化難度并增加產(chǎn)品的純度。需要用DNA酶(DNAase將殘留的DNA模板進行消除,在mRNA疫苗生產(chǎn)的過程中對DNA的殘留控制非常嚴格格。
三、mRNA高品質(zhì)
3.1 修飾核苷酸/核苷酸質(zhì)量標準
依據(jù)國際標準進行質(zhì)量檢測和質(zhì)量控制:
良好品質(zhì):產(chǎn)品純度可達99%以上,且批次間質(zhì)量穩(wěn)定;
無動物源成分:合成過程中不引入動物源成分,降低病毒污染風險;
無污染:每批次產(chǎn)品均通過DNA酶、RNA酶及內(nèi)毒素檢測,確保產(chǎn)品合成過程未引入外源無污染;
表達效率保證:產(chǎn)品經(jīng)過轉(zhuǎn)錄測試和表達測試,轉(zhuǎn)錄活性和表達活性優(yōu)于同類產(chǎn)品;
工業(yè)級產(chǎn)能:修飾核苷酸產(chǎn)能可滿足工業(yè)級應用,滿足核酸藥物從藥物開發(fā)到工業(yè)級生產(chǎn)的不同需求。
起發(fā)Pseudo-UTP純度: 99.2%
Me-Pseudo-UTP純度純度99.8%
3.2 酶質(zhì)量標準
mRNA合成酶系列產(chǎn)品,依據(jù)國際標準進行質(zhì)量檢測和質(zhì)量控制:
良好品質(zhì):產(chǎn)品純度可達95%以上,質(zhì)控精度優(yōu)于國產(chǎn)同類產(chǎn)品;
定量檢測:采用定量檢測方法檢測DNA酶、RNA酶殘留,精準定量微量殘留;
雜質(zhì)控制:每批次產(chǎn)品均通過DNA酶、RNA酶殘留檢測,檢測精度可達百萬分之一酶活單位;
嚴防污染:生產(chǎn)過程中不引入動物源成分,每批次產(chǎn)品均通過HIV、HBV、HCV檢測;
活性保證:產(chǎn)品經(jīng)過酶活測試,酶活達到行業(yè)標準。
RNA酶抑制劑純度100%
牛痘加帽酶純度99.99%
T7聚合酶酶純度100%
二氧甲基轉(zhuǎn)移酶純度99.46%
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